激光共聚焦掃描顯微鏡，它是使用激光作為掃描光源，可以快速的掃描成像，掃描的激光和熒光收集使用同一個物鏡，物鏡的焦點也就是掃描激光的聚焦點。系統(tǒng)經(jīng)過一次調(diào)焦，掃描限制在樣品的一個平面內(nèi)。調(diào)焦的深度不同時，就能夠得到樣品不同深度的層次的圖像，這些圖像信息都會存儲在計算機(jī)內(nèi)，然后通過計算機(jī)的分析，模擬，最后能夠顯示出細(xì)胞樣品的立體結(jié)構(gòu)。
     激光共聚焦掃描顯微鏡在結(jié)構(gòu)配置上，除了有普通的光學(xué)顯微鏡的基本構(gòu)造外，還包括了掃描裝置和檢測器，計算機(jī)系統(tǒng) (其中有數(shù)據(jù)采集、處理、轉(zhuǎn)換、應(yīng)用軟件等)、以及圖像輸出設(shè)備，光學(xué)裝置等一些其他部分。因為激光共聚焦顯微鏡具有高分辨率，高靈敏度，三維重建，動態(tài)分析等優(yōu)點，也就為基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)和臨床醫(yī)學(xué)的研究提供了有效手段。
     激光共聚焦顯微鏡，它脫離了傳統(tǒng)光學(xué)顯微鏡的場光源與局部平面成像模式，采用激光束作為光源，經(jīng)過照明針孔，在由分光鏡反射到物鏡，然后聚焦到樣品上，對標(biāo)本焦平面上進(jìn)行每一點掃描。如果組織樣品中有可被激發(fā)的熒光物質(zhì)，受到激發(fā)后發(fā)出的熒光經(jīng)原來入射光路直接反向回到分光鏡，通過探測針孔時先聚焦，聚焦后的光被光電倍增管（PMT）探測收集，將信號輸送到計算機(jī)，經(jīng)過處理后，計算機(jī)顯示器上會顯示出圖像 。